このため、糖質、脂質、アミノ酸など、各器官を構成する分子を酸化するなどして、体内に悪影響を与えてしまう。人間の体内でもっとも大量に発生するが、他に比べると反応性が低く、身体に与える影響も少ないと考えられている。ただし、電子や水素原子のやりとりが進むことで、ヒドロキシラジカルなど、毒性の強い活性酸素に変化する可能性が高い。過酸化水素の電子はすべてペアになっているため酸化力は大きくない。しかし、わずかなきっかけで2つに別れ、狂暴なヒドロキシラジカルになってしまうのが問題。過酸化水素はオキシドールとも呼ばれ、消毒薬として利用されているが実際に消毒殺菌作用を行っているのは、過酸化水素から変化したヒドロキシラジカルである場合が多いと言われている。活性酸素の中で最も反応性が強く、酸化力も強い。脂質、糖質、タンパク質など近くにあるあらゆる化合物と反応してしまう。つまり、体内への影響力が最も強い活性酸素なのだ。